표제지

목차

제1장 서론 8

1.1. 연구개념과 목적 8

1.2. 피부 마이크로바이옴 11

1.3. 아토피 피부염 17

1.4. Loop-mediated isothermal amplification(LAMP) 22

1.5. Lateral flow assay 27

제2장 실험 재료 및 방법 32

2.1. 샘플 준비 32

2.1.1. 균주 및 배양조건 32

2.1.2. DNA 추출 33

2.1.3. Lysis buffer test 샘플 준비 34

2.2. LAMP Primer Design 35

2.3. LAMP 38

2.3.1. LAMP Mixture 38

2.3.2. Electrophoresis 40

2.3.3. qLAMP 42

2.3.4. LAMP-LFD Assay 42

제3장 결과 및 토의 43

3.1. LAMP 최적화된 조건 43

3.1.1. LAMP Primer 농도 비율 최적화 43

3.1.2. LAMP 반응 온도 최적화 47

3.2. Lysis buffer Test 49

3.3. LAMP 특이성 51

3.4. LAMP 민감도 53

3.5. LAMP-LFD Test 56

제4장 결론 61

제5장 참고문헌 63

학회 발표 및 연구 논문 실적 70

국문 초록 71

Abstract 72

표 1-1. 아토피 피부염 진단 기준 18

표 2-1. LAMP Primer 37

표 2-2. LAMP mixture components 39

그림 1-1. 황색포도상구균 검출 키트 개략도 10

그림 1-2. 피부 마이크로바이옴의 역할 13

그림 1-3. 피부 마이크로바이옴의 다양한 요인과 구성 15

그림 1-4. 아토피피부염 병인 메커니즘 20

그림 1-5. LAMP 원리 개략도 23

그림 1-6. 다양한 LAMP 검출 방법 25

그림 1-7. LFA의 구성 요소와 원리 28

그림 1-8. 다양한 LFA 민감도 강화 방법 31

그림 2-1. 표적 서열의 유전자 지도와 프라이머의 위치 36

그림 2-2. Electrophoresis 개략도 41

그림 3-1. 외부 프라이머와 내부 프라이머의 농도 비율에 따른 증폭 결과 44

그림 3-2. 루프 프라이머와 내부 프라이머의 농도 비율에 따른 증폭 결과 46

그림 3-3. LAMP 반응 온도 최적화 48

그림 3-4. Lysis buffer Test 50

그림 3-5. LAMP 특이성 결과 52

그림 3-6. S.aureus gDNA 농도에 따른 LAMP 민감도 54

그림 3-7. S.aureus CFU에 따른 LAMP 민감도 55

그림 3-8. LAMP-LFD의 원리 개략도 58

그림 3-9. DNA 농도별 LAMP-LFD 결과 59

그림 3-10. S.aureus CFU 수별 LAMP-LFD 결과 60