배경
가장 흔한 악성 원발성 뇌종양인 교종은 여러 유전체 변화로 인해 발생한다. 중추신경계 종양의 진화하는 분류는 분자 검사의 중요성을 강조하고 있다. 차세대염기서열분석은 다양한 유전자 변화, 염색체 변화 및 유전자 재배열의 병렬 조합을 평가하여 치료 접근을 안내하는 가능한 변이를 식별한다. 이 연구는 다중 유전자 차세대염기서열분석 패널을 사용하여 교종 환자를 종합적으로 분석하여 진단 분류 및 표적 치료에 대한 유용한 통찰력을 제공한다. 이 분석 결과 단일유전자변이, 작은 삽입과 결실, 복제수 변이와 유전자 융합 및 유전자 내 삭제를 포함한 다양한 유전적 변화를 감지했다.
재료와 방법
총 147 명의 신경교종 환자로부터 추출한 포르말린 고정 및 파라핀이 포함된 핵산에 대해 표적 패널 기반 차세대염기서열분석을 수행하였다. 이 샘플들은 앰플리콘 캡쳐 기반 라이브러리 준비를 거쳤고 OCA 플랫폼을 사용하여 시퀀싱되었다. 그런 다음 사용 가능한 생물정보학 도구를 사용하여 결과 시퀀싱 데이터를 분석했다.
결과
단일유전자변이와 작은 삽입과 결실을 포함한 총 301 개의 돌연변이가 147 개의 종양 중 132 개에서 발견되어 사례의 89.8%를 차지했다. 이러한 돌연변이는 68 개의 다른 유전자에 있었다. 62 개의 종양 샘플 (42.2%)에서 유전자 증폭이 있는 복제수 변이가 25 개의 유전자에서 발생했다. 또한 25 개의 종양 샘플 (17.0%)에서 6 개의 유전자에서 유전자 융합과 유전자 내 삭제가 나타났다. 우리의 분석은 돌연변이가 있는 11 개, 복제수 변이가 있는 8 개, 유전자 융합 및 유전자 내 삭제가 있는 3 개를 포함하여 여러 유전자에서 실행 가능한 표적을 확인했다. 이러한 발견은 미국식품의약청 승인 치료법과 미국종합암네트워크 지침 기반 치료 및 진행 중인 임상 시험에 영향을 미칠 수 있다.
결론
차세대염기서열분석 기반 분자 분석을 통해 교종의 분류를 정확하게 진단하고, 유전적 변화의 빈도와 동시 발생을 자세히 설명하며, 교종 환자의 잠재적 치료 목표와 함께 유전적 변화를 식별하는 것을 분석했다. 고처리량 차세대염기서열분석은 신경종양학에서 분자 검사를 포괄적으로 지원하는 효율적이고 강력한 도구이다.