표제지

초록

목차

약어 목록 11

제1장 서론 14

제2장 연구대상 및 방법 23

제1절 연구 대상 23

제2절 연구 방법 24

1. pH 측정 24

2. 단백질체 분석을 위한 조직 준비 24

3. Tandem Mass Tag Labeling 26

4. 샘플 탈염 및 High-pH Reversed-Phase 펩티드 분획 26

5. RP-nano-LC-ESI-MS/MS 분석 27

6. Computational MS Data분석 28

7. 통계 분석 29

8. 생물정보학 분석 29

제3장 연구 결과 31

1. 참여 대상 및 뇌조직 샘플 31

2. 사후 뇌 조직의 정량적 단백질체 분석 32

3. 자살 완료자와 돌연사 사이에 차등적으로 발현되는 단백질 33

4. Ingenuity Pathway Analysis(IPA) 와 Gene Set Enrichment Analysis(GSEA) 분석 34

5. Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA) 분석 35

6. 임상적 요인에 따른 하위 그룹 분석 36

제4장 고찰 37

1. 자살사망과 관련되어 발굴된 생물학적인 경로의 의미 37

2. 기존 연구들과의 비교분석 39

3. 자살사망 위험 요인과의 연관성 41

4. 연구의 제한점 43

4.1. 작은 표본 크기 43

4.2. 표준화된 진단 과정의 부재, 교란 요인 44

4.3. 샘플 수집 과정에서의 편향 47

제5장 결론 49

참고 문헌 74

Abstract 83

[표 1] Suicide completers and sudden death samples used in pilot study Suicide 50

[표 2] Clinical characteristics of suicide completers and sudden death group. 51

[표 3] Detailed clinical characteristics of suicide completers 52

[표 4] Proteins related to clinical characteristics among suicide completers. 53

[그림 1] pH difference between suicide completers and sudden death group 54

[그림 2] Number of proteins quantified in brain tissue samples after suicide and sudden death: a pilot study 55

[그림 3] Dynamic range for quantified protein: a pilot study 56

[그림 4] Principle Component Analysis (PCA) results for quantified proteins : a pilot study 57

[그림 5] Research workflow for proteomic profiling using postmortem brain tissue 58

[그림 6] Detailed experimental workflow. 59

[그림 7] Dynamic range of pooled sample in four experimental sets. 60

[그림 8] Quantitative profiling of postmortem brain tissue samples. 61

[그림 9] Unsupervised hierarchical clustering of 574 proteins with significant expression differences in suicide and sudden death: a pilot study 62

[그림 10] Volcano Plot for 574 Proteins with significant expression differences between suicide and Sudden Death: a pilot study 63

[그림 11] Differentially expressed proteins. 64

[그림 12] Volcano plot for differentially expressed proteins. 65

[그림 13] Gene set enrichment analysis (GSEA) 66

[그림 14] WGCNA analysis: clustering 67

[그림 15] WGCNA analysis: eigengenes 68

[그림 16] Network analysis of blue module 69

[그림 17] Network analysis of turquoise module 70

[그림 18] Comparative studies. 71

[그림 19] DEPs expressed according to cell types(Endothelial cell, astrocyte, oligodendrocytes, neuron, microglia) 72

[그림 20] Venn diagrams for differentially expressed proteins between subgroups 73