표제지
목차
요약 11
I. 서론 13
II. 재료 및 방법 17
1. 시료 채집 17
2. 백수오 근권미생물의 Metagenome 분석 22
1) Metagenome 분석을 위한 DNA extraction 22
2) 추출한 DNA의 16S rDNA amplicon library제작과 454-pyrosequenicng 24
3) 은조롱 근권토양의 Metagenome Data 분석 26
3. 백수오 근권 미생물의 분리 및 동정 28
1) 미생물의 순수분리 및 배양 28
2) 분리된 미생물의 동정 30
III. 결과 44
1. 은조롱 근권으로부터 분리/제작한 16S rDNA amplicon library의 Metagenome 분석 44
1) Pyrosequencing 과 세균 군집 분석 44
2) Phylum 수준의 은조롱 근권미생물 군집 분석 47
3) Class 수준의 은조롱 근권미생물 군집 분석 53
4) Genus 수준의 은조롱 근권미생물 군집 분석 58
2. 배양 의존적 방법을 통한 미생물 군집 분석 61
1) BSO A 시료 분리 결과 61
2) BSO B 시료 분리 결과 65
3) b-103T 균주의 동정(이미지참조) 77
IV. 고찰 88
abstract 96
Table 1. Contents of Powerwater® DNA Isolation kit 23
Table 2. 16S rDNA amplicon library PCR condition 25
Table 3. Composition of R2A agar 29
Table 4. PCR condition 32
Table 5. Composition of PCR mixture 32
Table 6. Type strain used in this study 34
Table 7. Composition of API Reagent 38
Table 8. Composition of MIDI Reagent 40
Table 9. Metagenome analysis 46
Table 10. Bacterial community composition at the phylum level... 48
Table 11. Bacterial community composition at the phylum level... 50
Table 12. Bacterial community composition at the class level in... 54
Table 13. Bacterial community composition at the class level in... 56
Table 14. 백수오 A 분리 결과 69
Table 15. 백수오 B 분리결과 73
Table 16. Characteristics of b-103T(이미지참조) 81
Table 17. Results of API 20NE 82
Table 18. Results of API ZYM 83
Table 19. The Cellular fatty acid compositions of strain b-103T...(이미지참조) 85
Figure 1. BSO A GPS 지도 (GPS: 37.148914, 128.010556) 18
Figure 2. BSO B GPS 지도 (GPS: 36.923641, 128.202302) 19
Figure 3. BSO A 재배지 20
Figure 4. BSO B 재배지 21
Figure 5. MTP (Microbiome Taxonomic profiling) pipeline... 27
Figure 6. BSO Rarefaction curve 45
Figure 7. Bacterial community composition at the phylum level... 49
Figure 8. Bacterial community composition at the phylum level... 51
Figure 9. Comparison of Bacterial community composition... 52
Figure 10. Bacterial community composition at the class level... 55
Figure 11. Bacterial community composition at the class level... 57
Figure 12. Bacterial community composition at the Genus level... 59
Figure 13. Bacterial community composition at the genus level... 60
Figure 14. Neighbour-joining phylogenetic trees based on the... 78
Figure 15. Transmission Electron microscopy (TEM) of... 79
Figure 16. Phospholipids of strain b-103T after...(이미지참조) 86
Figure 17. Phospholipids of strain b-103T after...(이미지참조) 86
Figure 18. amino lipids of strain b-103T after...(이미지참조) 86
Figure 19. DAP of strain b-103T(이미지참조) 87