국문목차
표제지=0,1,4
목차=i,5,2
그림목차=iii,7,2
표목차=v,9,1
논문개요=vi,10,1
I. 서론=1,11,1
1.1 연구배경=1,11,2
1.2 연구 목적 및 내용=2,12,3
II. 관련 연구=5,15,1
2.1 단백질 상호작용 데이터(protein-protein interaction data)=5,15,4
2.2 기존의 신호전달 경로 추출방법=8,18,2
2.3 네트워크 뷰어(pathway network viewer)=9,19,3
III. 단백질 상호작용 정보와 위치정보를 활용한 신호전달 경로 추출=12,22,1
3.1 연구배경 및 방법론=12,22,4
3.2 단백질 상호작용 데이터와 위치정보를 활용한 신호전달 경로 추출=15,25,1
3.2.1 가능 경로 패스 찾기=15,25,6
3.2.2 단백질(protein)의 세포 내 위치 정보의 활용=20,30,3
3.2.3 결과 분석=22,32,7
IV. 단백질 상호작용 정보활용과 분석을 위한 가시화 시스템 구현=29,39,1
4.1 가시화 시스템의 개요=29,39,2
4.2 시스템 구성과 추가된 경로검색 및 분석 모듈=30,40,1
4.2.1 시스템 구성=30,40,4
4.2.2 시스템 개요 및 추가된 경로검색 및 분석 모듈 개요=33,43,5
4.2.3 시스템 입력과 기능=38,48,7
4.3 시스템 적용=44,54,1
4.3.1 가능 경로 검색 및 단백질 위치 정보 활용을 위한 시스템 적용 과정=44,54,7
4.3.2 가능 경로 검색과 세포 내 단백질 위치 정보를 통한 신호 전달 경로 분석 과정=50,60,5
V. 결론=55,65,2
참고문헌=57,67,3
ABSTRACT=60,70,2
[그림2-1] 단백질 상호작용을 그래프 자료구조로 표현=8,18,1
[그림2-2] PIVOT의 메인화면=10,20,1
[그림2-3] CNplot의 메인화면=11,21,1
[그림3-1] Saccharomyces cerevisiae 종에 대한 MAPKinase 신호전달 경로=13,23,1
[그림3-2] 단백질 상호작용과 위치정보를 이용한 신호전달 경로 추출 모델링=13,23,1
[그림3-3] 세포 내 21개의 위치분포=16,26,1
[그림3-4] Scoring Process(Mid2-Rlm1)=20,30,1
[그림3-5] KEGG 신호전달경로(signal transduction pathway)=25,35,1
[그림3-6] 상호작용 데이터와 위치데이터를 이용하여 찾은 신호 전달 경로 예=26,36,1
[그림3-7] STE2-STE12 사이의 신호 전달 경로 비교=28,38,1
[그림4-1] 단백질 상호작용 시스템 전체 실행 모습=30,40,1
[그림4-2] 시스템의 전체 구조=31,41,1
[그림4-3] BioNetView 시스템의 클래스 구성=34,44,1
[그림4-4] 일반 형태의 단백질 상호작용(PPI) 파일 형태=39,49,1
[그림4-5] 단백질의 기능 부가정보 파일 형태=39,49,1
[그림4-6] 단백질의 세포 내 위치 부가정보 파일 형태=40,50,1
[그림4-7] Bionetview의 시작 화면 및 주요 메뉴=42,52,1
[그림4-8] 메뉴 구성-File=43,53,1
[그림4-9] 메뉴 구성-View=43,53,1
[그림4-10] 메뉴 구성-Tool=44,54,1
[그림4-11] 상호작용 데이터 및 위치정보 데이터 입력 결과 화면=45,55,1
[그림4-12] 가능경로 검색 및 스코어링 메뉴 선택 화면=46,56,1
[그림4-13] 입력창 - 출발노드=46,56,1
[그림4-14] 입력창 - 도착노드=46,56,1
[그림4-15] 입력창 - 경로 길이=46,56,1
[그림4-16] 가능경로 검색 결과 화면=48,58,1
[그림4-17] 가능 경로에 대한 스코어링 결과 화면=48,58,1
[그림4-18] 스코어 결과 중 한 개의 경로 선택 시 나타나는 결과화면=49,59,1
[그림4-19] Bionetview이 보여주는 KEGG의 SHO1-STE 신호전달 경로=51,61,1
[그림4-20] SHO1-STE12사이의 가능 경로 중 가장 높은 SCOE를 갖는 경로=52,62,1
[그림4-21] SHO1-STE12사이의 가능 경로 예=54,64,1
[표3-1] 세포 내 단백질의 위치 별 분포=17,27,1
[표3-2] 가능경로찾기 알고리즘(Possible Path Algorithm)=19,29,1
[표3-3] 신호 전달 경로 추출 결과=23,33,1
[표3-4] 신호전달 경로의 SCORE 분포=24,34,1
[표3-5] STE2-STE12 사이의 신호 전달 경로 찾기 결과=27,37,1
[표4-1] BioNetView의 패키지와 모듈=34,44,3
[표4-2] ewha 패키지 내 클래스=36,46,2