생몰정보
소속
직위
직업
활동분야
주기
서지
국회도서관 서비스 이용에 대한 안내를 해드립니다.
검색결과 (전체 1건)
원문 있는 자료 (1) 열기
원문 아이콘이 없는 경우 국회도서관 방문 시 책자로 이용 가능
목차보기더보기
Title Page
Contents
1. Introduction 8
2. Materials and Methods 10
2.1. Sample collection 10
2.2. gDNA extraction 10
2.3. PCR amplification and sequencing 11
2.4. Bacterial phylogenetic analysis (QIIME & RDP) 12
2.5. Metagenome sequencing 13
2.6. Metagenome data analysis (assembly and annotation) 14
3. Results 15
3.1. Sample collection 15
3.2. Sequence data preparation 15
3.3. Richness & evenness 17
3.4. Taxonomy assignment by RDP 19
3.5. PCoA analysis 23
3.6. Metagenome sequencing data preparation 27
3.7. Metagenome taxonomy assignment 29
3.8. Virulence factors search by VFDB 31
4. Discussion 34
Reference 37
국문초록 42
ABSTRACT 44
Table 1. Number of sequences per each samples 16
Table 2. Richness and evenness of each samples calculated by QIIME 18
Table 3. Metagenome sequence information 28
Table 4. Metagenome contigs taxonomy assignment 30
Table 5. Metagenome reads VFDB BLASTX results 32
Fig 1. Phylum and genus level bar graph 22
Fig 2. PCoA Plot 24
Fig 3. Specific OTUs was observed differentiating pattern by temperature 25
Fig 4. Specific OTUs was observed differentiating pattern by growth stage 26
초록보기 더보기
Copepods는 수생생태계에 존재하는 동물성플랑크톤의 한 종류이다. Copepod는 거의 모든 수생 환경에 존재하며 먹이사슬의 하층부를 구성하고 있는 중요 먹이자원이다. Copepod 중 Tigriopus Kingsejongensis는 최근 남극에서 분리된 신종으로 2014년 남극 세종기지 앞 바다에서 분리되었다. 남극 요각류의 생장온도에 따른 장내미생물 군집변화를 관찰하기 위하여 T. kingsejongensis를 3가지 다른 온도(2℃, 8 ℃ 그리고15℃) 에서 배양시 T. kingsejongensis의 분변을 수집하였다. 3가지 온도중 15℃에서 T. kingsejongensis의 생장이 감소하였다. 이후 T. kingsejongensis의 분변내 존재하는 미생물 군집분석과 메타지놈 연구를 수행하였다. 각 온도별 우점미생물들의 차이를 보였는데, 2℃에서는 phylum Proteobacteria (54%) 과 family Flavobacteriaceae (27%)이 우점종으로 나타났으나 온도 증가에 따라 군집구성에 변화가 발생하였고, 2℃ 에서 15℃로 온도가 증가한 결과, phylum Proteobacteria (67%) family Flavobacteriaceae (6%)로 Proteobacteria 의 abundance 는 증가하였고, Flavobacteriaceae 의 abundance 는 감소하였다. 또한 메타지놈 분석을 통하여 Virulence Factors로 알려진 Vibrio cholerae O1 biovar E1 Tor str. N16961 유전자 (rtxA, tcpI)가 15℃ 에서 많이 확인되었다. 이를 통해 특정 박테리아 (예를 들어 Vibrio 와 Pseudoalteromonas)의 특정 생체기작이 T. kingsejongensis 의 생존과 생장에 영향을 미칠 가능성을 제시하였다.
원문구축 및 2018년 이후 자료는 524호에서 직접 열람하십시요.
도서위치안내: / 서가번호:
우편복사 목록담기를 완료하였습니다.
* 표시는 필수사항 입니다.
* 주의: 국회도서관 이용자 모두에게 공유서재로 서비스 됩니다.
저장 되었습니다.
로그인을 하시려면 아이디와 비밀번호를 입력해주세요. 모바일 간편 열람증으로 입실한 경우 회원가입을 해야합니다.
공용 PC이므로 한번 더 로그인 해 주시기 바랍니다.
아이디 또는 비밀번호를 확인해주세요
