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논문명/저자명
Characters and distribution patterns of a novel active retrotransposon CsRn1 in the genomes of hepatic trematodes clonorchis sinensis and opisthorchis viverrini [전자자료] / 배영안 인기도
발행사항
서울 : 가톨릭대학교 대학원, 2002.2
청구기호
전자형태로만 열람 가능함
형태사항
1 온라인자료 : PDF
자료실
전자자료
제어번호
KDMT1200237066
주기사항
학위논문(박사) -- 가톨릭대학교 대학원, 2002.2
원문
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표제지

감사의 글

CONTENTS

ABSTRACT 8

INTRODUCTION 10

MATERIALS AND METHODS 20

Parasites and DNA Extractions 20

AP-PCR and Cloning of Individual Worm-specific Products 20

Preparation of DNA Probes 21

Southern Blot Hybridization 22

Dot-blot Analysis 22

DNA-DNA Hybridization 23

Construction and Screening of Genomic DNA Library 23

Screening of cDNA Library by PCR Methods 24

Locus-Specific Typing 24

Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism(IRAP) 25

Sequence Analysis 25

Phylogenetic Analysis 26

RESULTS 28

I. Isolation and Characterization of a Novel Retrotransposon 28

Isolation of RAPDs by AP-PCR 28

Intragenomic Distribution of CsRn1 Copies 32

Identification of CsRn1 Master Copies 40

The Mobile Activity of CsRn1 Master copy 49

The Evolutionary Relationship of CsRn1 with Other Retrotransposons 52

II. The Distribution Pattern of CsRn1 among C. sinensis individual Genomes 57

Phylogenetic Analysis of CsRn1 LTR Sequences from Multiple Loci 57

Subfamilies of CsRn1 element 62

Comparison of Sequence Divergence between LTRs and rt Regions within CsRn1 Subfamilies 67

Locu-specific Typing of CsRn1 Intergrations among C. sinensis Individual Worms 70

Sequences in the CsRn1-containing Loci 71

The Target Sites for Integration of CsRn1 Elements 74

III. Comparative Studies on CsRn1 elements in the Hepatic Trematodes 76

Homology Level of Total Genomic DNAs between C. sinensis and O. viverrini 76

Distributions of CsRn1 in the Genomes of C. sinensis and O. viverrini 77

IRAP analysis among individuals of C. sinensis and O. viverrini 80

Sequence Variations within Several Regions of CsRn1 Elements 82

Phylogenetic Relationship among CsRn1 Elements 87

DISCUSSION 93

REFERENCE 102

영문 논문 제출서 113

영문 인준서 114

초록 115

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